首先要把中耳炎和疥癣病（兔子耳痒螨）区分开来。如果是螨虫造成的（耳内有圆筒状的痂皮，严重时耳廓肿胀、流分泌物。）可以用三氯杀螨醇治疗和对食槽、水碗的消毒。单纯治疗的话，还是用伊维菌素皮下注射效果较好，可以杀灭全身的螨虫和其它体内外寄生虫。1%的伊维菌素每公斤体重0.02-0.05毫升，7天以后再加强注射一次效果更好。
如果没有痂皮，只是流脓或者歪头，则是由巴士杆菌感染导致的中耳炎，可以用生理盐水清洗以后，滴入抗生素，必要时可以肌肉注射抗生素治疗。